RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462265.5

OPN3-202, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 5

Gene OPN3, Length 795 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-202ENST00000462265 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 MAP4K1Q92918 833 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CCDC120Q96HB5 630 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CCDC136Q96JN2 1154 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 TCEANC2Q96MN5 208 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SPATA33Q96N06 139 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CTAGE1Q96RT6 745 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 GPATCH2Q9NW75 528 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 TELO2Q9Y4R8 837 aa7□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 FAM221AA4D161 298 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CCDC69A6NI79 296 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CA3P07451 260 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 RAC2P15153 192 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 BFSP2Q13515 415 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 PKN1Q16512 942 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 TCTN1Q2MV58 587 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 KRT40Q6A162 431 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 REC114Q7Z4M0 266 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 MICU3Q86XE3 530 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 C7orf31Q8N865 590 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 FBXO27Q8NI29 283 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 PPTC7Q8NI37 304 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 TTC3P53804 2025 aa6.99□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 EPOPA6NHQ4 379 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 NBNO60934 754 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 DDAH1O94760 285 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 F2P00734 622 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 PFKMP08237 780 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CKBP12277 381 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 ACTN1P12814 892 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 MCM4P33991 863 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 MCM5P33992 734 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 DEFB103AP81534 67 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 GHRHRQ02643 423 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 GPNMBQ14956 572 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 UBE2SQ16763 222 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 KSR1Q8IVT5 923 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SLC38A3Q99624 504 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 DUSP13Q9UII6 198 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.98□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 LCHNA4D1U4 455 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 HAS3O00219 553 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 LGALS2P05162 132 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 KIF5BP33176 963 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 RFC2P35250 354 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 THPOP40225 353 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 KCNJ6P48051 423 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 NECTIN1Q15223 517 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 SESTD1Q86VW0 696 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CAGE1Q8TC20 777 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 CUL5Q93034 780 aa6.97□□□□□ -1.29
OPN3-202ENST00000462265 KIRREL1Q96J84 757 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms