RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 SLC44A4Q53GD3 710 aa28.99■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 BCO2Q9BYV7 579 aa28.99■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 OSBPL6Q9BZF3 934 aa28.99■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 LRRN2O75325 713 aa28.98■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 TKTP29401 623 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 CD300LGQ6UXG3 332 aa28.98■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 C8orf76Q96K31 380 aa28.98■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 BHMT2Q9H2M3 363 aa28.98■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 TNFSF13BQ9Y275 285 aa28.98■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 TRIP11Q15643 1979 aa28.98■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 K7ERI5 159 aa28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 TTC38Q5R3I4 469 aa28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 BORCS6Q96GS4 357 aa28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 KXD1Q9BQD3 176 aa28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 PATJQ8NI35 1801 aa28.97■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 GRM5P41594 1212 aa28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 MAGEA9P43362 315 aa28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 YARSP54577 528 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 ECM1Q16610 540 aa28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF528Q3MIS6 628 aa28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 RUBCNQ92622 972 aa28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 GDE1Q9NZC3 331 aa28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 FBXO4Q9UKT5 387 aa28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 STK24Q9Y6E0 443 aa28.96■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa28.95■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ECI2O75521 394 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 TRAPPC10P48553 1259 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 UBXN2BQ14CS0 331 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 XKR4Q5GH76 650 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 KIAA2013Q8IYS2 634 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 HINFPQ9BQA5 517 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 POLD4Q9HCU8 107 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 SLC38A7Q9NVC3 462 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 LRWD1Q9UFC0 647 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 COL4A3Q01955 1670 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 DMXL1Q9Y485 3027 aa28.95■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 LAMTOR5O43504 91 aa28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 KINO60870 393 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 RHOP08100 348 aa28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 BRCC3P46736 316 aa28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 SLC8B1Q6J4K2 584 aa28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF461Q8TAF7 563 aa28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ING5Q8WYH8 240 aa28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 CDT1Q9H211 546 aa28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 LTB4R2Q9NPC1 389 aa28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 KIAA1024Q9UPX6 916 aa28.94■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 FRYLO94915 3013 aa28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGEF37A1IGU5 675 aa28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 FAM170BA6NMN3 283 aa28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 I3L4J1 428 aa28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ROR1Q01973 937 aa28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ALKAL1Q6UXT8 129 aa28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 CEP120Q8N960 986 aa28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 RMDN1Q96DB5 314 aa28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM134Q9H6X4 195 aa28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 LRG1P02750 347 aa28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ELF1P32519 619 aa28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 PDIA5Q14554 519 aa28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 SLC5A9Q2M3M2 681 aa28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF568Q3ZCX4 644 aa28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 C4orf32Q8N8J7 132 aa28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 NELL2Q99435 816 aa28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 PTPRHQ9HD43 1115 aa28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.92■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC169A6NNP5 214 aa28.91■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 PODXLO00592 558 aa28.91■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ABLIM3O94929 683 aa28.91■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 PTPN2P17706 415 aa28.91■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 NPTX2P47972 431 aa28.91■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 PEX3P56589 373 aa28.91■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PBRM1-218ENST00000458294 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms