RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIG1P18858 919 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 TKTP29401 623 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 NBL1P41271 181 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 BRCC3P46736 316 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPTX2P47972 431 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLCNKBP51801 687 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PEX3P56589 373 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPP2R5AQ15172 486 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 UPP1Q16831 310 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 HYIQ5T013 277 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEPTORQ8TB45 409 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIFAP3Q92845 792 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGF14Q92915 247 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTPALQ9BTX7 342 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTRRQ9UBK8 725 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 FRYLO94915 3013 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEP192Q8TEP8 1941 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACNA1AO00555 2505 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 GFRA3O60609 400 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIP1RO75146 1068 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8AP07357 584 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CFHP08603 1231 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXA9P31269 272 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRPHP41219 470 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRM5P41594 1212 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 EFNA5P52803 228 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CREMQ03060 361 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB33AQ14088 237 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEP57Q86XR8 500 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIX5Q8N196 739 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 FLCNQ8NFG4 579 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR152Q8TDT2 470 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 STAMQ92783 540 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNX27Q96L92 541 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 WNT16Q9UBV4 365 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUP205Q92621 2012 aa9.29□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR23AA6NEV1 266 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 SFI1A8K8P3 1242 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7ERI5 159 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAD1O00515 517 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCL16O15467 120 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBC1D4O60343 1298 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 POU2F2P09086 479 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRFP11831 508 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1D2P34982 312 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC12A3P55017 1021 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 OSTNP61366 133 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PARM1Q6UWI2 310 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITFG1Q8TB96 612 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMX3Q96JJ7 454 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFT74Q96LB3 600 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIDD1Q9HB75 910 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNTN3Q9P232 1028 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPP7Q9UHL4 492 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CA14Q9ULX7 337 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.28□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR27A2RRH5 827 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SHISA7A6NL88 538 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC16A4O15374 487 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST18O60284 1047 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM189A1O60320 539 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 B3GAT3O94766 335 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABLIM3O94929 683 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLULP15104 373 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNE1P15382 129 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 FSHRP23945 695 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 GUCY2CP25092 1073 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ROR1Q01973 937 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms