RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 A0A1B0GUA9 196 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 CTAGE9A4FU28 777 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.271e-8■■■■□ 21.8
CTU2-202ENST00000453996 B4GALT4O60513 344 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 ADAMTS4O75173 837 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 HMGCRP04035 888 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 STAG3L1P0CL83 205 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 CXCL8P10145 99 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 YY1P25490 414 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 DUOXA2Q1HG44 320 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 CXCL17Q6UXB2 119 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 OSMRQ99650 979 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 MTMR12Q9C0I1 747 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 ATP8B3O60423 1300 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 FGFR4P22455 802 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 NCOA4Q13772 614 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 TMEM192Q8IY95 271 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 GNRH1P01148 92 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 NME8Q8N427 588 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 TNNC2P02585 160 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 TNFAIP3P21580 790 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.272e-6■■■■□ 26
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CTU2-202ENST00000453996 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 RAET1EQ8TD07 263 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 AGPAT1Q99943 283 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 PCNTO95613 3336 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 TRIM58Q8NG06 486 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 CITO14578 2027 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 CYP26A1O43174 497 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 TACC1O75410 805 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 CLSTN1O94985 981 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 ERO1AQ96HE7 468 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 SGPL1O95470 568 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 CUL2Q13617 745 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 SNX17Q15036 470 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 NOTUMQ6P988 496 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 ARID3AQ99856 593 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTU2-202ENST00000453996 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 LACTBL1A8MY62 500 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 MOCS3O95396 460 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ASGR1P07306 291 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 KRT5P13647 590 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 GRM5P41594 1212 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 PDE6CP51160 858 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 TRPC3Q13507 836 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 NOX5Q96PH1 765 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 ASB7Q9H672 318 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 INTUQ9ULD6 942 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.95■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTU2-202ENST00000453996 NPTXRO95502 500 aa22.94■■□□□ 1.26
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