RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452779.2

CSAG1-204, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-204ENST00000452779 TTC26A0AVF1 554 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 HIDE1A8MVS5 230 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 TISP43B9A030 160 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 TRAPPC3O43617 180 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 B3GAT3O94766 335 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 GARTP22102 1010 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 TNFSF9P41273 254 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 GLUD2P49448 558 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 ADAM15Q13444 863 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 NAB2Q15742 525 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 USP41Q3LFD5 358 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF507Q8TCN5 953 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 ASB2Q96Q27 587 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 SLC39A2Q9NP94 309 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 IRAK3Q9Y616 596 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 LACTBL1A8MY62 500 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 C2CD2LO14523 706 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 KIF4AO95239 1232 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 CLCNKBP51801 687 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 TFF2Q03403 129 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 EHHADHQ08426 723 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 COL19A1Q14993 1142 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 PPFIBP1Q86W92 1011 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 HASPINQ8TF76 798 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 FAM213AQ9BRX8 229 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 VN1R3Q9BXE9 311 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 IKZF4Q9H2S9 585 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 ASB7Q9H672 318 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 FAM50BQ9Y247 325 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-204ENST00000452779 F8W810 466 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 H3BQ06 376 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 PODXLO00592 558 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 KLRC4O43908 158 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 FAM189A1O60320 539 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 KIF20AO95235 890 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 IL18RAPO95256 599 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 CYP3A5P20815 502 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 KLRC2P26717 231 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 ADSSP30520 456 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 CREMQ03060 361 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 SPAG1Q07617 926 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 PTPN14Q15678 1187 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 UPP1Q16831 310 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 CEP57Q86XR8 500 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 GLIS3Q8NEA6 775 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 BEST2Q8NFU1 509 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 GPR62Q9BZJ7 368 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 PCIF1Q9H4Z3 704 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 DERAQ9Y315 318 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 LINC01565O15544 149 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 EXTL3O43909 919 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 ADH1AP07327 375 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 ADRB2P07550 413 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 DSG1Q02413 1049 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 PDXDC1Q6P996 788 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 TAS1R1Q7RTX1 841 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 NELFCDQ8IXH7 590 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 GPR65Q8IYL9 337 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-204ENST00000452779 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms