RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438979.6

ABCC5-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 5, human

TSL 5

Gene ABCC5, Length 821 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC5-208	ENST00000438979	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	WASF3	Q9UPY6	502 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	PPME1	Q9Y570	386 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	MOSPD3	O75425	235 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	PTPN2	P17706	415 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	SPINK2	P20155	84 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	NPY5R	Q15761	445 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	XKR9	Q5GH70	373 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	IRF7	Q92985	503 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	LXN	Q9BS40	222 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979		I3L4J1	428 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	GIPC1	O14908	333 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	PSMC3	P17980	439 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	GLRA2	P23416	452 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	ARL2	P36404	184 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	SOX9	P48436	509 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	CEP68	Q76N32	757 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	MTR	Q99707	1265 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	NID2	Q14112	1375 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	ABLIM3	O94929	683 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	SEC24A	O95486	1093 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	GJA1	P17302	382 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	HOXA6	P31267	233 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	NLRP5	P59047	1200 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	KBTBD6	Q86V97	674 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	HAS1	Q92839	578 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCC5-208	ENST00000438979	LAMA1	P25391	3075 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	RECQL4	O94761	1208 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	EPN2	O95208	641 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	TH	P07101	528 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	BRCC3	P46736	316 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	ROR1	Q01973	937 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	TFDP1	Q14186	410 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	EPHA7	Q15375	998 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	INF2	Q27J81	1249 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979		Q6ZUG5	572 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	POTED	Q86YR6	584 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCC5-208	ENST00000438979	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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