RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436949.5

SEMA3A-204, Transcript of semaphorin 3A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEMA3A, Length 2,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3A-204ENST00000436949 GJC1P36383 396 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 ADCY8P40145 1251 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 MSH2P43246 934 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 CRYMQ14894 314 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 ACER1Q8TDN7 264 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 NACC1Q96RE7 527 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 COA1Q9GZY4 146 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 A0A1B0GUA9 196 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 CCDC189A1A4V9 331 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 GJB6O95452 261 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 TTC4O95801 387 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 RRM1P23921 792 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 DNAJC3Q13217 504 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 PPP2R5CQ13362 524 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 RIPK1Q13546 671 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 STRA6Q9BX79 667 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 LRRC19Q9H756 370 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 PI4KBQ9UBF8 816 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 USP20Q9Y2K6 914 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.15□□□□□ -1.26
SEMA3A-204ENST00000436949 UTRNP46939 3433 aa7.15□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CYP1A2P05177 515 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CFHP08603 1231 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 KRT5P13647 590 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ALADP13716 330 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 PEX19P40855 299 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MXI1P50539 228 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SOX10P56693 466 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MTM1Q13496 603 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TMED2Q15363 201 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 NFIL3Q16649 462 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CEP55Q53EZ4 464 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ASRGL1Q7L266 308 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 LDHDQ86WU2 507 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SPDL1Q96EA4 605 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 SERPINB12Q96P63 405 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 FSCN2O14926 492 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GGPS1O95749 300 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MYBL1P10243 752 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 RALAP11233 206 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ETS1P14921 441 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 GM2AP17900 193 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 ITGB5P18084 799 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TAC1P20366 129 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 MAPK4P31152 587 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 PEX3P56589 373 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 CETN1Q12798 172 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.14□□□□□ -1.27
SEMA3A-204ENST00000436949 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms