RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 MTMR12Q9C0I1 747 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 ACKR2O00590 384 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 OGTO15294 1046 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 PTENP60484 403 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 MCL1Q07820 350 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 ACVR2BQ13705 512 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 NCOA4Q13772 614 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 KRT222Q8N1A0 295 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 FZD8Q9H461 694 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 RNF14Q9UBS8 474 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 AKT3Q9Y243 479 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 H3BRB1 525 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 CEP104O60308 925 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 VTNP04004 478 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 MAPK4P31152 587 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 NOP14P78316 857 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 GPC5P78333 572 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 CUL2Q13617 745 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 AMFRQ9UKV5 643 aa24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 A0A087WZ62 844 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 PPFIA4O75335 1185 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 MYBL2P10244 700 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 GZMAP12544 262 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 PLA2G4AP47712 749 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 ST7Q9NRC1 585 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 TUBBP07437 444 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 PROZP22891 400 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 HES6Q96HZ4 224 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 C8orf74Q6P047 294 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 WDR49Q8IV35 697 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM192Q8IY95 271 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 USP38Q8NB14 1042 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 L1RE1Q9UN81 338 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-209ENST00000428120 MMP3P08254 477 aa24.89■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM270Q6UE05 265 aa24.89■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 PBKQ96KB5 322 aa24.89■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.89■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.89■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 ASAP2O43150 1006 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 CLTAP09496 248 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF653Q96CK0 615 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 KRT12Q99456 494 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 PHKA2P46019 1235 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 BTBD6Q96KE9 485 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 FAM81BQ96LP2 452 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 CDT1Q9H211 546 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 ATP8B1O43520 1251 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 MYL6P60660 151 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 PPFIA1Q13136 1202 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 CES2O00748 559 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEB2O15479 319 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 HOXC6P09630 235 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 CPB2Q96IY4 423 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 ALG6Q9Y672 507 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 CFHP08603 1231 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 CXCL8P10145 99 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-209ENST00000428120 MCM3P25205 808 aa24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms