RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC14Q15048 493 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF280CQ8ND82 737 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 HELQQ8TDG4 1101 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 KLRG1Q96E93 195 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 RUNDC3BQ96NL0 473 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 ASIC3Q9UHC3 531 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 GHRP10912 638 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF15Q66K64 600 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOC3L1Q86VI1 746 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG4AQ8WYN0 398 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM84AQ96KN4 292 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 SCLT1Q96NL6 688 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 TAAR1Q96RJ0 339 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 UVRAGQ9P2Y5 699 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS6P62753 249 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 XRCC4Q13426 336 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 MTMR1Q13613 665 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 CNGA2Q16280 664 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TAOK1Q7L7X3 1001 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 GPATCH11Q8N954 259 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 PARD3BQ8TEW8 1205 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM174Q8WUU8 243 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 CLMNQ96JQ2 1002 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 NCAPGQ9BPX3 1015 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM7Q9C029 511 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC19Q9H756 370 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 CHST7Q9NS84 486 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ANAPC7Q9UJX3 599 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 DOCK1Q14185 1865 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK13O15264 365 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT5P13647 590 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 CHKAP35790 457 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 XKR9Q5GH70 373 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 NT5C1BQ96P26 610 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 AAASQ9NRG9 546 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 CREB1P16220 341 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TAX1BP1Q86VP1 789 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM228AQ86W67 206 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 DYDC1Q8WWB3 177 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 BRCA2P51587 3418 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXO6A8MYZ6 492 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TP73O15350 636 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 CNGA1P29973 690 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 NCKAP1LP55160 1127 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 VGLL4Q14135 290 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ACAD10Q6JQN1 1059 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP57Q86XR8 500 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXL13Q8NEE6 735 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 PI4K2AQ9BTU6 479 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TBX20Q9UMR3 447 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK4P31152 587 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ITIH4Q14624 930 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 IWS1Q96ST2 819 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM8AQ9HCN3 771 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 MLXIPLQ9NP71 852 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB20Q9NX57 234 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP19.93■□□□□ 0.781e-10■■■■□ 25.6
SH3BP1-202ENST00000417536 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 VWA5AO00534 786 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 FSCN2O14926 492 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 PMM2O15305 246 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP2K2P36507 400 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 SP4Q02446 784 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 C2CD6Q53TS8 623 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 KIFAP3Q92845 792 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC134Q9H6E4 229 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 GGT7Q9UJ14 662 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 USP20Q9Y2K6 914 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 GRIN3BO60391 1043 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 PLA2G6O60733 806 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 USP2O75604 605 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS41P49754 854 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 GPC3P51654 580 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 SOX10P56693 466 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TREML2Q5T2D2 321 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD5Q6N075 450 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-202ENST00000417536 LLGL2Q6P1M3 1020 aa19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms