RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411827.1

CDC42-204, Transcript of cell division cycle 42, humanhuman

TSL 3

Gene CDC42, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-204ENST00000411827 APOL6Q9BWW8 343 aa20.19■□□□□ 0.82
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CDC42-204ENST00000411827 RNF39Q9H2S5 420 aa20.19■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 A0A1B0GTH6 734 aa20.18■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.18■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.18■□□□□ 0.82
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CDC42-204ENST00000411827 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.18■□□□□ 0.82
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CDC42-204ENST00000411827 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.16■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.16■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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CDC42-204ENST00000411827 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.822e-8■■■□□ 15.4
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CDC42-204ENST00000411827 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.16■□□□□ 0.82
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CDC42-204ENST00000411827 NR1I3Q14994 352 aa20.15■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.15■□□□□ 0.82
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CDC42-204ENST00000411827 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.15■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 TRIM5Q9C035 493 aa20.15■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 DPP3Q9NY33 737 aa20.15■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 KLK14Q9P0G3 267 aa20.15■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 CITO14578 2027 aa20.15■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.15■□□□□ 0.82
CDC42-204ENST00000411827 CEP290O15078 2479 aa20.15■□□□□ 0.82
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CDC42-204ENST00000411827 TRIM49CP0CI26 452 aa20.14■□□□□ 0.81
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CDC42-204ENST00000411827 PPP3CAQ08209 521 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 TUSC3Q13454 348 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 BIRC3Q13489 604 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 TRPC3Q13507 836 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 RASIP1Q5U651 963 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 LRRC43Q8N309 656 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.14■□□□□ 0.81
CDC42-204ENST00000411827 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.14■□□□□ 0.81
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