RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC138Q96M89 665 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 EXTL3O43909 919 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM253P0C7T8 217 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF235Q14590 738 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 TADA2BQ86TJ2 420 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 NUDCD3Q8IVD9 361 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 PHF2O75151 1096 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 HAUS5O94927 633 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 CETPP11597 493 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 KLRK1P26718 216 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 POU5F1BQ06416 359 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 TAF11Q15544 211 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF677Q86XU0 584 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 ZDHHC15Q96MV8 337 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 FGFR2P21802 821 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 PHEXP78562 749 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 ULK4Q96C45 1275 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 ASIC4Q96FT7 647 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 TJP2Q9UDY2 1190 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 PPME1Q9Y570 386 aa16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-203ENST00000409212 NEMP1O14524 444 aa16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 VSNL1P62760 191 aa16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 CYTH2Q99418 400 aa16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 EPC1Q9H2F5 836 aa16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 CFAP69A5D8W1 941 aa16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 E5RI56 91 aa16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 ITIH2P19823 946 aa16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 NOP14P78316 857 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 MUTP22033 750 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 CAP2P40123 477 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 ARFIP2P53365 341 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 LAMC2Q13753 1193 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 RASSF3Q86WH2 238 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 SH3TC2Q8TF17 1288 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 RAPGEF5Q92565 580 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 BTBD6Q96KE9 485 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRC37BQ96QE4 947 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC13A4Q9UKG4 626 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 RRN3P2A6NIE6 340 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 MSH4O15457 936 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 GYPCP04921 128 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 GYS1P13807 737 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 STMN1P16949 149 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 MMP14P50281 582 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 TAAR1Q96RJ0 339 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 SULT1E1P49888 294 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 ASAP3Q8TDY4 903 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFATQ9P243 1243 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 SCOCQ9UIL1 159 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 MORF4L2Q15014 288 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 PTPAQ15257 358 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM247A6NEH6 219 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 GRIK1P39086 918 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 NPEPPSP55786 919 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 POLLQ9UGP5 575 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 PSMD3O43242 534 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 SPAG7O75391 227 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 CYP2C9P11712 490 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 DEUP1Q05D60 604 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 CCL15Q16663 113 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 EFCAB12Q6NXP0 572 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 TTC23LQ6PF05 361 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 MTHFD1LQ6UB35 978 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-203ENST00000409212 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
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