RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 ALDH2P05091 517 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CYP3A5P20815 502 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 NR2F2P24468 414 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC11A1P49279 550 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 PLCB3Q01970 1234 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 ZBTB6Q15916 424 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 MLKLQ8NB16 471 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 SPG21Q9NZD8 308 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 STK39Q9UEW8 545 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 LZTS1Q9Y250 596 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.55■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 BICDL2A1A5D9 508 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 NRP1O14786 923 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 FGF18O76093 207 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 NLRP12P59046 1061 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 UBE3AQ05086 875 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 PAK1Q13153 545 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 JADE1Q6IE81 842 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 KLHL23Q8NBE8 558 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 FAM212AQ96EL1 285 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 KIF12Q96FN5 646 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 IGSF21Q96ID5 467 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CERS4Q9HA82 394 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 DACH1Q9UI36 760 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.54■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 TRIM49BA6NDI0 452 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 EPOPA6NHQ4 379 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 ITGB1P05556 798 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 NFICP08651 508 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 LRPAP1P30533 357 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 PBX3P40426 434 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 OR1G1P47890 313 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 ENPEPQ07075 957 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CYP24A1Q07973 514 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 ADAM9Q13443 819 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 GPM6BQ13491 265 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 GRIN2CQ14957 1233 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 PSMD6Q15008 389 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 SPATA1Q5VX52 437 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 ANKRD40Q6AI12 368 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 BEST2Q8NFU1 509 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 NELFBQ8WX92 580 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM169Q96HH4 297 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 MARCH5Q9NX47 278 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CTNND2Q9UQB3 1225 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 VWA8A3KMH1 1905 aa16.53■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 LAMA3Q16787 3333 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 TSC2P49815 1807 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CETN3O15182 167 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 WNT7BP56706 349 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 KRT17Q04695 432 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 UPP1Q16831 310 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CEP135Q66GS9 1140 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 TTI2Q6NXR4 508 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 WDR49Q8IV35 697 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 DEFB123Q8N688 67 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 RDH13Q8NBN7 331 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 CGRRF1Q99675 332 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 PRDM12Q9H4Q4 367 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 PDE11AQ9HCR9 933 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 RWDD2AQ9UIY3 292 aa16.52■□□□□ 0.24
ACTBP8-201ENST00000403258 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 LPXNO60711 386 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 AKAP3O75969 853 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 EFEMP2O95967 443 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CASP4P49662 377 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CLCNKBP51801 687 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 SPAG1Q07617 926 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 Q7L0L9 218 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms