RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 EXOC3O60645 756 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NUDT17P0C025 328 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 CYP2J2P51589 502 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 EPHA7Q15375 998 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 JAMLQ86YT9 394 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 CCDC127Q96BQ5 260 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PARVGQ9HBI0 331 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 A6NHS1 94 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PLA2G6O60733 806 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 CREB1P16220 341 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 CTNNA2P26232 953 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TUBP50607 506 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ADAM9Q13443 819 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PEX10O60683 326 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ACSL3O95573 720 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SFNP31947 248 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 COASYQ13057 564 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NAV1Q8NEY1 1877 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RIT2Q99578 217 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PXMP2Q9NR77 195 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PTPN22Q9Y2R2 807 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RIPK3Q9Y572 518 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RPA1P27694 616 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 OAZ1P54368 228 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 CNTN2Q02246 1040 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 STRN3Q13033 797 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ANO7Q6IWH7 933 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNK18Q7Z418 384 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM237Q96Q45 408 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM4Q9C037 500 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 C2CD2Q9Y426 696 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 STX2P32856 288 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MUM1Q2TAK8 710 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PADI6Q6TGC4 694 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TEX9Q8N6V9 391 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 DEPTORQ8TB45 409 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 C18orf8Q96DM3 657 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PNMA5Q96PV4 448 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MAP3K13O43283 966 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 UCHL3P15374 230 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PTENP60484 403 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 LAMB3Q13751 1172 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 DUPD1Q68J44 220 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GANQ9H2C0 597 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RXFP1Q9HBX9 757 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SCN9AQ15858 1988 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 M0R2N6 131 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PIK3CDO00329 1044 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 LGR5O75473 907 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GGPS1O95749 300 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PSMC5P62195 406 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 PGM5Q15124 567 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 AADACL2Q6P093 401 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SFR1Q86XK3 245 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MFN1Q8IWA4 741 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RASGEF1CQ8N431 466 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms