RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 JCADQ9P266 1359 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NEK2P51955 445 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SLC18A3Q16572 532 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SBK1Q52WX2 424 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM69Q86WT6 500 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KCNK16Q96T55 309 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CPS1P31327 1500 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 C5orf58C9J3I9 102 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KRT14P02533 472 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CDH6P55285 790 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 OSTNP61366 133 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GPSM2P81274 684 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PTK6Q13882 451 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SUSD4Q5VX71 490 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 C18orf8Q96DM3 657 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PIK3C2BO00750 1634 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 AGLP35573 1532 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FNTAP49354 379 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CENPCQ03188 943 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PI16Q6UXB8 463 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DACH2Q96NX9 599 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FAM107AO95990 144 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TXNRD1Q16881 649 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MYH10P35580 1976 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SLC25A27O95847 323 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MARK3P27448 753 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RRM2BQ7LG56 351 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NLRP14Q86W24 1093 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ECT2Q9H8V3 914 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HACD3Q9P035 362 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GDAQ9Y2T3 454 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K13O43283 966 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GSNP06396 782 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KCNA2P16389 499 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GTF2H1P32780 548 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RBBP7Q16576 425 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EPC1Q9H2F5 836 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KIF1AQ12756 1690 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TERF2Q15554 542 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 AAASQ9NRG9 546 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 POTEFA5A3E0 1075 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 OCM2P0CE71 109 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 POTEIP0CG38 1075 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 POTEGQ6S5H5 508 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 BRINP3Q76B58 766 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TEX9Q8N6V9 391 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CDC26Q8NHZ8 85 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RNF217Q8TC41 542 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MAPK1P28482 360 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HADHAP40939 763 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HPCAP84074 193 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CNGA3Q16281 694 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EXT2Q93063 718 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NYAP2Q9P242 653 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF263O14978 683 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SLC16A4O15374 487 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D4O60343 1298 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PYGMP11217 842 aa6.32□□□□□ -1.4
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