RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM136AQ96C01 138 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 RGL1Q9NZL6 768 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 LRCH1Q9Y2L9 728 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 EMSYQ7Z589 1322 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 P4HA2O15460 535 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SGPL1O95470 568 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CBX6O95503 412 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 HSPA2P54652 639 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ATL2Q8NHH9 583 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FIZ1Q96SL8 496 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 DCLK3Q9C098 648 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 NMRK1Q9NWW6 199 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SREBF1P36956 1147 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SAR1AQ9NR31 198 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.55■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SPAG7O75391 227 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 PICALMQ13492 652 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 MYBPC2Q14324 1141 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 LLGL1Q15334 1064 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC6Q16204 474 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SPOCK2Q92563 424 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 PWWP2AQ96N64 755 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SCOCQ9UIL1 159 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 EML1O00423 815 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TOM1O60784 492 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 EPC2Q52LR7 807 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 RDH13Q8NBN7 331 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 C9orf72Q96LT7 481 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CD209Q9NNX6 404 aa21.54■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 GSTA2P09210 222 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SKIP12755 728 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 RFC5P40937 340 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CENPCQ03188 943 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 DDB1Q16531 1140 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC125Q86Z20 511 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FOXP3Q9BZS1 431 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SENP1Q9P0U3 644 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP3K13O43283 966 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CIITAP33076 1130 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 VPS41P49754 854 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CDR2Q01850 454 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC89Q8N998 374 aa21.53■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 RRM1P23921 792 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 GRAPQ13588 217 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 RASA3Q14644 834 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 IZUMO3Q5VZ72 239 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 NSMFQ6X4W1 530 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF365Q70YC5 407 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TDRPQ86YL5 185 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 KIFAP3Q92845 792 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SMC6Q96SB8 1091 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TRABDQ9H4I3 376 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 PIDD1Q9HB75 910 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 C2CD2LO14523 706 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 DLG4P78352 724 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FMO1Q01740 532 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ODR4Q5SWX8 454 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FYB2Q5VWT5 728 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF398Q8TD17 642 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM4Q9C037 500 aa21.52■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 MYH11P35749 1972 aa21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms