RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 THTPAQ9BU02 230 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 SPATA16Q9BXB7 569 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 SYNCQ9H7C4 482 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ATXN10Q9UBB4 475 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 DNM3Q9UQ16 869 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 RRM1P23921 792 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 PDIA5Q14554 519 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ARSHQ5FYA8 562 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 KAT5Q92993 513 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF711Q9Y462 761 aa21.87■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 KRT4P19013 534 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 C12orf60Q5U649 245 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 RINLQ6ZS11 566 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC6Q86X45 466 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 STK33Q9BYT3 514 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 B2RBV5 119 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 KITP10721 976 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 DESP17661 470 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 INHBCP55103 352 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 EPC2Q52LR7 807 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 SPATA24Q86W54 205 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 HAUS1Q96CS2 278 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ZWILCHQ9H900 591 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 BANF1O75531 89 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 FGRP09769 529 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 MYL7Q01449 175 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ACVR2BQ13705 512 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 LIN52Q52LA3 116 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 RASSF3Q86WH2 238 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 DTNBP1Q96EV8 351 aa21.86■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 FAM13AO94988 1023 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 CTNNA2P26232 953 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 FMO5P49326 533 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 PLCB3Q01970 1234 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 C1orf146Q5VVC0 180 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 C10orf82Q8WW14 230 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 TTC17Q96AE7 1141 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 KRT82Q9NSB4 513 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 TTC36A6NLP5 189 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ARFIP2P53365 341 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 JAM2P57087 298 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 BPIFB4P59827 614 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 C6orf163Q5TEZ5 329 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 NDE1Q9NXR1 346 aa21.85■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 MAGEA4P43358 317 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 COG7P83436 770 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ASMTLO95671 621 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 SATL1Q86VE3 508 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 NSL1Q96IY1 281 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 TIPINQ9BVW5 301 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 TJP1Q07157 1748 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 CIB2O75838 187 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ITIH2P19823 946 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 MOGSQ13724 837 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.84■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 SUPT3HO75486 399 aa21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 GYS1P13807 737 aa21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 GCLMP48507 274 aa21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 DSG1Q02413 1049 aa21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 MAPK6Q16659 721 aa21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 FGFR1P11362 822 aa21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ATP6V1B1P15313 513 aa21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 ATF3P18847 181 aa21.83■■□□□ 1.09
CMTM4-201ENST00000330687 HOXD13P35453 343 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms