RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 B4GALT3O60512 393 aa29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 EXOC3O60645 756 aa29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 RPL13P26373 211 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 UBE3AQ05086 875 aa29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 SURF1Q15526 300 aa29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 CENPPQ6IPU0 288 aa29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 BRSK2Q8IWQ3 736 aa29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 STK39Q9UEW8 545 aa29.07■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 NR3C1P04150 777 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 ITGB1P05556 798 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 BMP6P22004 513 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 PBX3P40426 434 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 EDRF1Q3B7T1 1238 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 NT5DC4Q86YG4 428 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM169Q96HH4 297 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 IGSF21Q96ID5 467 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 TSG101Q99816 390 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 LMCD1Q9NZU5 365 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 LZTS1Q9Y250 596 aa29.06■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 SZT2Q5T011 3432 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 RFXAPO00287 272 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 CYP3A5P20815 502 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB6Q15916 424 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 RDH13Q8NBN7 331 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 SPPL3Q8TCT6 385 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 LMAN2LQ9H0V9 348 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 C2CD2Q9Y426 696 aa29.05■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 RPL9P32969 192 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 PTPROQ16827 1216 aa29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 JADE1Q6IE81 842 aa29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 CBWD2Q8IUF1 395 aa29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 GDPD5Q8WTR4 605 aa29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa29.04■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 CASTOR2A6NHX0 329 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 CCNE1P24864 410 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC63Q05C16 580 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 SPAG1Q07617 926 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 ADAM9Q13443 819 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM132DQ14C87 1099 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 ZCWPW2Q504Y3 356 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC183Q5T5S1 534 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 BEST2Q8NFU1 509 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 TRANK1O15050 2925 aa29.03■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 GRM6O15303 877 aa29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 LPXNO60711 386 aa29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 NR2F2P24468 414 aa29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 MLKLQ8NB16 471 aa29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 GUCD1Q96NT3 240 aa29.02■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
CRIP1-201ENST00000330233 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CD44P16070 742 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 UPP1Q16831 310 aa29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA1Q5VX52 437 aa29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD40Q6AI12 368 aa29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 POF1BQ8WVV4 589 aa29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 MFSD14AQ96MC6 490 aa29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 PDE11AQ9HCR9 933 aa29.01■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 BICDL2A1A5D9 508 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 MAPK13O15264 365 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TADA2AO75478 443 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CLCNKBP51801 687 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CYP24A1Q07973 514 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CEP135Q66GS9 1140 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 FOXR2Q6PJQ5 311 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 PAAF1Q9BRP4 392 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 ADAM28Q9UKQ2 775 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 MYO7AQ13402 2215 aa29■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CETN3O15182 167 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 NFICP08651 508 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 IGFBP4P22692 258 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 LRPAP1P30533 357 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 PSMD6Q15008 389 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 KLHL10Q6JEL2 608 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 NELFBQ8WX92 580 aa28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms