RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 HASPINQ8TF76 798 aa9.89□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 GRM6O15303 877 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 EXOC3O60645 756 aa9.88□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 OR1G1P47890 313 aa9.88□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.88□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 CEP135Q66GS9 1140 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 TTI2Q6NXR4 508 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.87□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 NELFBQ8WX92 580 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 GUCD1Q96NT3 240 aa9.87□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF233A6NK53 670 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 H3BNC9 293 aa9.87□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF516Q92618 1163 aa9.86□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.86□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 B3GAT3O94766 335 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 ERVFC1P60507 584 aa9.85□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 NFIL3Q16649 462 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.85□□□□□ -0.83
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