RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.03■■□□□ 1.28
MESP1-201ENST00000300057 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
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MESP1-201ENST00000300057 PDE6CP51160 858 aa23.02■■□□□ 1.28
MESP1-201ENST00000300057 BIRC3Q13489 604 aa23.02■■□□□ 1.28
MESP1-201ENST00000300057 SEZ6Q53EL9 994 aa23.02■■□□□ 1.28
MESP1-201ENST00000300057 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.02■■□□□ 1.28
MESP1-201ENST00000300057 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.02■■□□□ 1.28
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MESP1-201ENST00000300057 ZACNQ401N2 412 aa23■■□□□ 1.27
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MESP1-201ENST00000300057 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
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MESP1-201ENST00000300057 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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MESP1-201ENST00000300057 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.98■■□□□ 1.27
MESP1-201ENST00000300057 TCHPQ9BT92 498 aa22.98■■□□□ 1.27
MESP1-201ENST00000300057 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.97■■□□□ 1.27
MESP1-201ENST00000300057 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
MESP1-201ENST00000300057 CLDN3O15551 220 aa22.97■■□□□ 1.27
MESP1-201ENST00000300057 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
MESP1-201ENST00000300057 TTLL4Q14679 1199 aa22.97■■□□□ 1.27
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