RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 UCHL3P15374 230 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 KLC1Q07866 573 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ERP27Q96DN0 273 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF6Q15052 776 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM154Q6P9G4 183 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ZIM3Q96PE6 472 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 RUBCNLQ9H714 662 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 SUPT3HO75486 399 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 APOA1P02647 267 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 NAB2Q15742 525 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 THAP11Q96EK4 314 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 SCARF1Q14162 830 aa25.44■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TRADDQ15628 312 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF12Q96FN5 646 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 C9orf72Q96LT7 481 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 RGL1Q9NZL6 768 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 PJA2O43164 708 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 FMO5P49326 533 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF555Q8NEP9 628 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.43■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 MED14O60244 1454 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 PTK2BQ14289 1009 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 JAMLQ86YT9 394 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 SULT1E1P49888 294 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ANO4Q32M45 955 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 COL15A1P39059 1388 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPC1P48995 793 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TTLL4Q14679 1199 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 C16orf89Q6UX73 402 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 DTNBP1Q96EV8 351 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 H0Y626 953 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM16O95361 564 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 PSD3Q9NYI0 1048 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 AKR1B1P15121 316 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 POLIQ9UNA4 740 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.42■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 AKAP10O43572 662 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 C21orf2O43822 256 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 DAB1O75553 588 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP55Q53EZ4 464 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 C18orf8Q96DM3 657 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM54Q9BYV2 358 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V1E1P36543 226 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TTLL6Q8N841 843 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF26Q96DR7 871 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ASIC4Q96FT7 647 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 PCMTD2Q9NV79 361 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PQJ5 194 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA33Q96N06 139 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 LZTS1Q9Y250 596 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 APRTP07741 180 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 GFAPP14136 432 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINB9P50453 376 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K10Q02779 954 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF2BQ8N4N8 673 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 WRNIP1Q96S55 665 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 REEP2Q9BRK0 252 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 PPCSQ9HAB8 311 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.41■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNK16Q96T55 309 aa25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM120BA0PK00 339 aa25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 TPI1P60174 286 aa25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 KYAT1Q16773 422 aa25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 KDELC2Q7Z4H8 507 aa25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC9Q8WXX5 260 aa25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 NARFQ9UHQ1 456 aa25.4■■□□□ 1.66
GNPTAB-201ENST00000299314 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms