RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF446Q9NWS9 450 aa24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.48■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 HOXC6P09630 235 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 POU5F1BQ06416 359 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 WDR49Q8IV35 697 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 RFFLQ8WZ73 363 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 USP6NLQ92738 828 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 PNKPQ96T60 521 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CDT1Q9H211 546 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf54Q08AI8 447 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 NCOA4Q13772 614 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 AMHR2Q16671 573 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 MS4A14Q96JA4 679 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR12Q9C0I1 747 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 SETD4Q9NVD3 440 aa24.47■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 PASKQ96RG2 1323 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 CDR2Q01850 454 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 GRM1Q13255 1194 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM192Q8IY95 271 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 FAM81BQ96LP2 452 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 A6NJR5 290 aa24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
VSTM4-201ENST00000298454 GPR25O00155 361 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 RTN2O75298 545 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CLSTN1O94985 981 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 INHBEP58166 350 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 NOP14P78316 857 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CUL2Q13617 745 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 FAM187BQ17R55 369 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC181Q5TID7 509 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 DAAM2Q86T65 1068 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 NLRP7Q8WX94 980 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CPB2Q96IY4 423 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 COG5Q9UP83 839 aa24.45■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 AP3M2P53677 418 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CRHR2Q13324 411 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TLK2Q86UE8 772 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 GJD2Q9UKL4 321 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CLTAP09496 248 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 RPS6KA1Q15418 735 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA4Q8NEY3 305 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ZIC5Q96T25 663 aa24.44■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 KIF4AO95239 1232 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 GZMAP12544 262 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 KAT2BQ92831 832 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 SCLT1Q96NL6 688 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ZEB2O60315 1214 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CXCL8P10145 99 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 RGS2P41220 211 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 SURF1Q15526 300 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 PEX26Q7Z412 305 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.43■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 F2P00734 622 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CTGFP29279 349 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 PAFAH1B1P43034 410 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 GPC5P78333 572 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 SYCE1Q8N0S2 351 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 RAB21Q9UL25 225 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 KCNK3O14649 394 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 MYL6P60660 151 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 IRF5Q13568 498 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.42■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ASS1P00966 412 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TAF4BQ92750 862 aa24.41■■□□□ 1.5
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