RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 KAZNQ674X7 775 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 RILPQ96NA2 401 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 IWS1Q96ST2 819 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PLA2G12BQ9BX93 195 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJC18Q9H819 358 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa12.1□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ITGA2BP08514 1039 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PRDX5P30044 214 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 NPEPPSP55786 919 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 AP2B1P63010 937 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 KCNA1Q09470 495 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MPP3Q13368 585 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 RINLQ6ZS11 566 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CYFIP1Q7L576 1253 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TTC7BQ86TV6 843 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 RHOT2Q8IXI1 618 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ATL2Q8NHH9 583 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SLC26A7Q8TE54 656 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 NAT14Q8WUY8 206 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SIKE1Q9BRV8 207 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SPEF2Q9C093 1822 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 HARSP12081 509 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CHRNB2P17787 502 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 FUT4P22083 530 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ADRA1DP25100 572 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ADARP55265 1226 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MMEL1Q495T6 779 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SMC1BQ8NDV3 1235 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 AGBL1Q96MI9 1066 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 KCNQ5Q9NR82 932 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 PCYOX1Q9UHG3 505 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MAGEB3O15480 346 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 KRT4P19013 534 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CDK7P50613 346 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 GPC5P78333 572 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 MECOMQ03112 1051 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CBX3Q13185 183 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 EPHA7Q15375 998 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SLC35G1Q2M3R5 365 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SLC44A4Q53GD3 710 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SESTD1Q86VW0 696 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ANKMY2Q8IV38 441 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC110Q8TBZ0 833 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 GATA6Q92908 595 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ECSITQ9BQ95 431 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 NUP85Q9BW27 656 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 EBF3Q9H4W6 596 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ACP6Q9NPH0 428 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 IL17RBQ9NRM6 502 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 KRT82Q9NSB4 513 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 BTG4Q9NY30 223 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 SLIT3O75094 1523 aa12.08□□□□□ -0.47
PTPRR-201ENST00000283228 TNS3Q68CZ2 1445 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PPM1 405 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RSPH10B2B2RC85 870 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 EYA4O95677 639 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RSPH10BP0C881 870 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ITIH2P19823 946 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PRKCIP41743 596 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 FRMD5Q7Z6J6 570 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC6Q86X45 466 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 C10orf82Q8WW14 230 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PYDC1Q8WXC3 89 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 SLC5A5Q92911 643 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 YIPF2Q9BWQ6 316 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 BCAS3Q9H6U6 928 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ANPEPP15144 967 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MAGEA4P43358 317 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 STAT4Q14765 748 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MFSD4BQ5TF39 518 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MYCT1Q8N699 235 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 MTBPQ96DY7 904 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF212Q9UDV6 495 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PPATQ06203 517 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 COBLL1Q53SF7 1204 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRR-201ENST00000283228 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms