RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 STK24Q9Y6E0 443 aa14.28□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 RASSF9O75901 435 aa14.27□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 CD19P15391 556 aa14.27□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 PEX5P50542 639 aa14.27□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 SPP2Q13103 211 aa14.27□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.27□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 DMAC2Q9NW81 257 aa14.27□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 TBX20Q9UMR3 447 aa14.27□□□□□ -0.12
TMOD1-201ENST00000259365 NCANO14594 1321 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 LRRD1A4D1F6 860 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 SGK1O00141 431 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 NEBLO76041 1014 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 MAP3K6O95382 1288 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ADSSP30520 456 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 MPP2Q14168 576 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TLCD1Q96CP7 247 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.27□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 CA4P22748 312 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 MMP13P45452 471 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF131P52739 623 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 OVGP1Q12889 678 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 GPS1Q13098 491 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 FAM228AQ86W67 206 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TMX2Q9Y320 296 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ATP6V1G2O95670 118 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 BSNDQ8WZ55 320 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 IDI2Q9BXS1 227 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TCF4P15884 667 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 CDR2Q01850 454 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 DRP2Q13474 957 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 SPATA21Q7Z572 469 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 SNF8Q96H20 258 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.26□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 KRT19P08727 400 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 SYNCQ9H7C4 482 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ABCA3Q99758 1704 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 YDJCA8MPS7 323 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 F5H423 210 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 POTEJP0CG39 1038 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 CETPP11597 493 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ELF1P32519 619 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 TAS2R40P59535 323 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 HHATQ5VTY9 493 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 PGM2Q96G03 612 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ANP32DO95626 131 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 KRT1P04264 644 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 MARK3P27448 753 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 WDR78Q5VTH9 848 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 IFT74Q96LB3 600 aa14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 KAT6AQ92794 2004 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 CETN2P41208 172 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ARSEP51690 589 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 MTMR2Q13614 643 aa14.24□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms