RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MGAT3Q09327 533 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT79Q5XKE5 535 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.134e-6■□□□□ 9.2
CAPNS1-201ENST00000246533 GINS2Q9Y248 185 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MAFO75444 373 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MARSP56192 900 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A5Q01650 507 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM119Q4V9L6 283 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TTMPQ5BVD1 217 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RPAINQ86UA6 219 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MICALL1Q8N3F8 863 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 POLD4Q9HCU8 107 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF365Q70YC5 407 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 OTUD6AQ7L8S5 288 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM143Q96AN5 459 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ZIM3Q96PE6 472 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 GGA2Q9UJY4 613 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH10P35580 1976 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEB2O15479 319 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 SHHQ15465 462 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 KIZQ2M2Z5 673 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 KSR1Q8IVT5 923 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TNNC1P63316 161 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCWPW2Q504Y3 356 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM240Q5SV17 173 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM40Q8WWA1 233 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NACC1Q96RE7 527 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 IL23AQ9NPF7 189 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKEF1Q9NU02 776 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP8B3O60423 1300 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCR5P32302 372 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC18A3Q16572 532 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM26DQ5JW98 314 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MEI1Q5TIA1 1274 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MAEAQ7L5Y9 396 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 BHMT2Q9H2M3 363 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 SALL4Q9UJQ4 1053 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 AKT3Q9Y243 479 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 GUCY2CP25092 1073 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNMA1Q12791 1236 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.132e-7■□□□□ 8.5
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CAPNS1-201ENST00000246533 HPS3Q969F9 1004 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL8AQ96BM9 186 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFAB1O14561 156 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 GHRP10912 638 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 LRIG3Q6UXM1 1119 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 AIPL1Q9NZN9 384 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NCK2O43639 380 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR32O75388 356 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 EMC2Q15006 297 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC40Q4G0X9 1142 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPH3Q86UC2 560 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 GPRC5CQ9NQ84 441 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0754O94854 1291 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ANXA13P27216 316 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 BMP8BP34820 402 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 LPIN1Q14693 890 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HYIQ5T013 277 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A3Q8WY07 619 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 OSMRQ99650 979 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NT5C3AQ9H0P0 336 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 EPN3Q9H201 632 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 EPB41L5Q9HCM4 733 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 GLI1P08151 1106 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 DYMQ7RTS9 669 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CAND2O75155 1236 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PALMO75781 387 aa28.3■■■□□ 2.12
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