RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 RASSF10A6NK89 507 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ARPP19P56211 112 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 EMBQ6PCB8 327 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 RUNDC3BQ96NL0 473 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 TISP43B9A030 160 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 HLA-DRAP01903 254 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ERVK-9P63128 1117 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 LY6KQ17RY6 165 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 COG1Q8WTW3 980 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 YY1AP1Q9H869 796 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 FCGRTP55899 365 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 OSTNP61366 133 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 MTMR3Q13615 1198 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM270Q6UE05 265 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 HACE1Q8IYU2 909 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 FAM71BQ8TC56 605 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 BTBD7Q9P203 1132 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 TLR2O60603 784 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 MYBL1P10243 752 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 HOXD13P35453 343 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 SNX16P57768 344 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ITIH3Q06033 890 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 PPP3CAQ08209 521 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 GNASQ5JWF2 1037 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 SV2AQ7L0J3 742 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 PARP2Q9UGN5 583 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 USTQ9Y2C2 406 aa11.35□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 APC2O95996 2303 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 TTC36A6NLP5 189 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 AMPD2Q01433 879 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 SLC7A5Q01650 507 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 PPFIA1Q13136 1202 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 KYAT1Q16773 422 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 WDR93Q6P2C0 686 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF677Q86XU0 584 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 FAM76AQ8TAV0 307 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 SCINQ9Y6U3 715 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF263O14978 683 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 STRNO43815 780 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 TOM1L1O75674 476 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 FGGP02679 453 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 GZMAP12544 262 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 GBP1P32455 592 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 NUP85Q9BW27 656 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 MED7O43513 233 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ADCY3O60266 1144 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF862O60290 1169 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D8O95759 1140 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF699Q32M78 642 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 NAA35Q5VZE5 725 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.34□□□□□ -0.59
PRRX1-201ENST00000239461 SPTBN2O15020 2390 aa11.33□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 GNA15P30679 374 aa11.33□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 PSMC4P43686 418 aa11.33□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 RWDD2BP57060 319 aa11.33□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 DLG4P78352 724 aa11.33□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 NCOA4Q13772 614 aa11.33□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.33□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 ZPBP2Q6X784 338 aa11.33□□□□□ -0.6
PRRX1-201ENST00000239461 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms