RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAJB1P25685 340 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 OR1G1P47890 313 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP2J2P51589 502 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 CAMK1Q14012 370 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 MORC3Q14149 939 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 BRSK2Q8IWQ3 736 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 RABGGTAQ92696 567 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 MARCH5Q9NX47 278 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.65■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 WNT7BP56706 349 aa23.64■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 NFKBIBQ15653 356 aa23.64■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBTB6Q15916 424 aa23.64■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.64■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM212AQ96EL1 285 aa23.64■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.64■■□□□ 1.38
SLC25A39-201ENST00000225308 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.64■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 CD302Q8IX05 232 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 XXYLT1Q8NBI6 393 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM169Q96HH4 297 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 ASB7Q9H672 318 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 DMAC2Q9NW81 257 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 LZTS1Q9Y250 596 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.63■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 NFICP08651 508 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 UBE3AQ05086 875 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 JADE1Q6IE81 842 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC9A9Q8IVB4 645 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 ADSSL1Q8N142 457 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 POF1BQ8WVV4 589 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF12Q96FN5 646 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 SCN1AP35498 2009 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 IL18RAPO95256 599 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 MBD3O95983 291 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 NR3C1P04150 777 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 FOSL2P15408 326 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 IGFBP4P22692 258 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 UPP1Q16831 310 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM130Q8N3G9 435 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 TSPAN18Q96SJ8 248 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.62■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 VWA8A3KMH1 1905 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF233A6NK53 670 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF4AO95239 1232 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 CLCNKBP51801 687 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 KRT17Q04695 432 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 CENPPQ6IPU0 288 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 EFCAB13Q8IY85 973 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 C2CD2Q9Y426 696 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 EXOC3O60645 756 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 EFEMP2O95967 443 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 NFIL3Q16649 462 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 RDH13Q8NBN7 331 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 C3orf58Q8NDZ4 430 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 UROC1Q96N76 676 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 TLR9Q9NR96 1032 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 DERAQ9Y315 318 aa23.6■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 CALUO43852 315 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 CSPG5O95196 566 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 PTMSP20962 102 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 ERVFC1P60507 584 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 PTPROQ16827 1216 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP3A5P20815 502 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 NR2F2P24468 414 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 IRS1P35568 1242 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 CASP4P49662 377 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 GUCY2FP51841 1108 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 MYBPC2Q14324 1141 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA1Q5VX52 437 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 HASPINQ8TF76 798 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC25A39-201ENST00000225308 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms