RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220429.12

GABPB1-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1, Length 2,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-201ENST00000220429 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
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GABPB1-201ENST00000220429 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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GABPB1-201ENST00000220429 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
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