RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640393.1

RTTN-217, Transcript of rotatin, humanhuman

TSL 5

Gene RTTN, Length 1,357 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTTN-217ENST00000640393 ATP5JP18859 108 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 AKAP5P24588 427 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 SCNN1GP51170 649 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PTTG1IPP53801 180 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 DSC2Q02487 901 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CREMQ03060 361 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 SP140Q13342 867 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PGS1Q32NB8 556 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 LCE4AQ5TA78 99 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 ZNF529Q6P280 563 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 C14orf80Q86SX3 495 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 TTC7BQ86TV6 843 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MAP3K14Q99558 947 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MNTQ99583 582 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.21□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 B8ZZF3 427 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 RFPL1O75677 317 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 HSPA6P17066 643 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SELENOPP49908 381 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 CLRN1P58418 232 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 MTM1Q13496 603 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 MLC1Q15049 377 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 CSRP2Q16527 193 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 PRR18Q8N4B5 295 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 EXTL1Q92935 676 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 HPS3Q969F9 1004 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 MVB12AQ96EY5 273 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 B5MCH6 92 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 ZNF20P17024 532 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 ADAM17P78536 824 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 EDAQ92838 391 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 XDHP47989 1333 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 CYP27B1O15528 508 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 POMCP01189 267 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SMARCA1P28370 1054 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 MAN2A2P49641 1150 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 RABGGTBP53611 331 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 ATP8B2P98198 1209 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SPATS1Q496A3 300 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 NRN1LQ496H8 165 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 MED25Q71SY5 747 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 DOK3Q7L591 496 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 IFI44Q8TCB0 444 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 LEFTY2O00292 366 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 PLSCR1O15162 318 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 FAM20BO75063 409 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SBK3P0C264 359 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 CTXN1P60606 82 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SNAPC2Q13487 334 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 GTF2H3Q13889 308 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 VPS72Q15906 364 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 C3orf20Q8ND61 904 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 OR10H5Q8NGA6 315 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 RGMAQ96B86 450 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 GPR20Q99678 358 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 ARMT1Q9H993 441 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 NMRK2Q9NPI5 230 aa7.18□□□□□ -1.26
RTTN-217ENST00000640393 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms