RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640077.1

MED17-223, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 5

Gene MED17, Length 2,210 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-223	ENST00000640077	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	RIN1	Q13671	783 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ANO4	Q32M45	955 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077		Q8TCH9	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077		B8ZZF3	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	WNT3A	P56704	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	MGAT5	Q09328	741 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	BECN1	Q14457	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ICAM4	Q14773	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	CPS1	P31327	1500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	NCAN	O14594	1321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ZNF623	O75123	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	MTNR1B	P49286	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077		E9PCH4	1651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	IQGAP1	P46940	1657 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	PRRG2	O14669	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	NRP1	O14786	923 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ANAPC15	P60006	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	MTMR1	Q13613	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	TULP2	O00295	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	TMEM127	O75204	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SELENOP	P49908	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	KRT85	P78386	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SATB1	Q01826	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	GRM7	Q14831	915 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	ACAP1	Q15027	740 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	KRT40	Q6A162	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	EDA	Q92838	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MED17-223	ENST00000640077		A0A1W2PRX2	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	GOLIM4	O00461	696 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TOM1	O60784	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	COMT	P21964	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	SLC5A3	P53794	718 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ADAM17	P78536	824 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	FATE1	Q969F0	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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