RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	POLH	Q9Y253	713 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF536	O15090	1300 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175		B5MCH6	92 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	TEX33	O43247	280 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	PRC1	O43663	620 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ARIH2	O95376	493 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	HRG	P04196	525 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	SYN1	P17600	705 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	MAL	P21145	153 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	USP14	P54578	494 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	CSRP2	Q16527	193 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	METTL24	Q5JXM2	366 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	DACT2	Q5SW24	774 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ANKS6	Q68DC2	871 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	MFSD5	Q6N075	450 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	RSPH3	Q86UC2	560 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	C3orf20	Q8ND61	904 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ARL8A	Q96BM9	186 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	FAM167A	Q96KS9	214 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	C20orf173	Q96LM9	149 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	FAM227A	F5H4B4	570 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	ZBED1	O96006	694 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	TYR	P14679	529 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	HTR1B	P28222	390 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	PTH1R	Q03431	593 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	SNAPC2	Q13487	334 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175		Q6ZSN1	163 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	HTR3D	Q70Z44	454 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	FAM83A	Q86UY5	434 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175		Q8TCH9	128 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	STON2	Q8WXE9	905 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	TIFA	Q96CG3	184 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	MRI1	Q9BV20	369 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	CD248	Q9HCU0	757 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	JAG2	Q9Y219	1238 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		3.96	□□□□□ -1.77
ATRX-223	ENST00000637175		A0A088AWK7	358 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	TPP1	O14773	563 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	CAND2	O75155	1236 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	RAP2A	P10114	183 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	MYB	P10242	640 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	ATP5J	P18859	108 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	RABGGTB	P53611	331 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	CLRN1	P58418	232 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	RAB1A	P62820	205 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	ICAM4	Q14773	271 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	NFIX	Q14938	502 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATRX-223	ENST00000637175	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		3.96	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms