RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SCRN1Q12765 414 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF528Q3MIS6 628 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 ING5Q8WYH8 240 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD17B14Q9BPX1 270 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 BRMS1Q9HCU9 246 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 LTB4R2Q9NPC1 389 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 GPRC5CQ9NQ84 441 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 SNTG2Q9NY99 539 aa30.27■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 STK36Q9NRP7 1315 aa30.26■■■□□ 2.44
CAPNS1-217ENST00000629983 LIG1P18858 919 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PRIMPOLQ96LW4 560 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa30.26■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 ARID2Q68CP9 1835 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 DMXL1Q9Y485 3027 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT2P35908 639 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 NR5A1Q13285 461 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 TPRG1Q6ZUI0 275 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 OSBPL6Q9BZF3 934 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 TM6SF1Q9BZW5 370 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa30.25■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGESO14684 152 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 N4BP3O15049 544 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 RECQL4O94761 1208 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1D2P34982 312 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 TXKP42681 527 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEA9P43362 315 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 NPAS3Q8IXF0 933 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PDZD7Q9H5P4 517 aa30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 WASF1Q92558 559 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 BORCS6Q96GS4 357 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 ADPGKQ9BRR6 497 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 COL4A3Q01955 1670 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 NCOR2Q9Y618 2525 aa30.23■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB33AQ14088 237 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 NOSTRINQ8IVI9 506 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 MCRS1Q96EZ8 462 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNH3Q9ULD8 1083 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR179Q6PRD1 2367 aa30.22■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 NCAM2O15394 837 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP2B1P20020 1258 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 UVSSAQ2YD98 709 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 MCPH1Q8NEM0 835 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf40Q9H1Z8 148 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN32Q9NX65 697 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 GDAQ9Y2T3 454 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 CDY1Q9Y6F8 540 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP250Q9BV73 2442 aa30.21■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL13PA6NNM8 815 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 NEMFO60524 1076 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKCBP05771 671 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 POU2F2P09086 479 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 TARSP26639 723 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL16Q9H2A7 254 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 FZD8Q9H461 694 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 USP20Q9Y2K6 914 aa30.2■■■□□ 2.43
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 SDHBP21912 280 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPK6Q16659 721 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM187BQ17R55 369 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 TSSK4Q6SA08 328 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF852Q6ZMS4 543 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 NELL2Q99435 816 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MTRRQ9UBK8 725 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 USP18Q9UMW8 372 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH15Q9Y2K3 1946 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GAT3O94766 335 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOP08100 348 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 GLRA4Q5JXX5 417 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 DEPTORQ8TB45 409 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 HEBP1Q9NRV9 189 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 PFKFB2O60825 505 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 ECI2O75521 394 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 FGFR3P22607 806 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 NAB2Q15742 525 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 TPCN1Q9ULQ1 816 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH14Q0VDD8 3507 aa30.17■■■□□ 2.42
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