RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	SYT13	Q7L8C5	426 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	YAF2	Q8IY57	180 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TSPYL6	Q8N831	410 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	NYAP2	Q9P242	653 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	KAT6A	Q92794	2004 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	VWA8	A3KMH1	1905 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ESYT2	A0FGR8	921 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	SOD2	P04179	222 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	NUDT7	P0C024	238 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF853	P0CG23	659 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CDK8	P49336	464 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	GLUD2	P49448	558 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	FOSB	P53539	338 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	GRIK2	Q13002	908 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ANO7	Q6IWH7	933 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TTC8	Q8TAM2	541 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	OSBP2	Q969R2	916 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ACD	Q96AP0	544 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	LURAP1	Q96LR2	239 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	FNBP1	Q96RU3	617 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM209	Q96SK2	561 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SNAP23-222	ENST00000626061	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR182	O15218	404 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	IGSF3	O75054	1194 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF883	P0CG24	379 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CEBPB	P17676	345 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GNAI1	P63096	354 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SGO2	Q562F6	1265 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	USP53	Q70EK8	1073 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	RLN3	Q8WXF3	142 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	RUBCNL	Q9H714	662 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	IFT57	Q9NWB7	429 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GINS2	Q9Y248	185 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ACAN	P16112	2415 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	AP5Z1	O43299	807 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	MTSS1	O43312	755 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	VPS4B	O75351	444 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CER1	O95813	267 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CDK4	P11802	303 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CD99	P14209	185 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ITGB5	P18084	799 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GNLY	P22749	145 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	HOXA9	P31269	272 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	P2RY2	P41231	377 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC11A1	P49279	550 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT76	Q01546	638 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GRIK4	Q16099	956 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SLFN13	Q68D06	897 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	LILRA6	Q6PI73	481 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	RASSF3	Q86WH2	238 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GBP3	Q9H0R5	595 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	VPS4A	Q9UN37	437 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PQD8	194 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CHAD	O15335	359 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	PRKCG	P05129	697 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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