RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621870.4

GGA3-223, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 1 (best)

Gene GGA3, Length 4,034 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-223	ENST00000621870	AKR1A1	P14550	325 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	IRX4	P78413	519 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	KRT17	Q04695	432 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	BFSP2	Q13515	415 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	MTF1	Q14872	753 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	IQCB1	Q15051	598 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	PGM5	Q15124	567 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	RGMB	Q6NW40	437 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	STMN2	Q93045	179 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	AGPAT1	Q99943	283 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	KLC2	Q9H0B6	622 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870		A0A1W2PQC6	194 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	TMEM150B	A6NC51	233 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	CYTH3	O43739	400 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	STAG3L1	P0CL83	205 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	NOG	Q13253	232 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	TLK2	Q86UE8	772 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	ASIC4	Q96FT7	647 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	CFAP36	Q96G28	342 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	YME1L1	Q96TA2	773 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		9.81	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	GPR182	O15218	404 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	NCK2	O43639	380 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	TOM1L1	O75674	476 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	CASP4	P49662	377 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	BEX3	Q00994	111 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	RAD51	Q06609	339 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	PDXDC1	Q6P996	788 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	TTC13	Q8NBP0	860 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	HASPIN	Q8TF76	798 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	VPS39	Q96JC1	886 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	GLTPD2	A6NH11	291 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	IL18RAP	O95256	599 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	INHBE	P58166	350 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	EVX2	Q03828	476 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	KRT33B	Q14525	404 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	PTPA	Q15257	358 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	STK33	Q9BYT3	514 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	SP110	Q9HB58	689 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	NAGPA	Q9UK23	515 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	USP20	Q9Y2K6	914 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	MT-ND3	P03897	115 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	TAF6	P49848	677 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	SLC26A2	P50443	739 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	PSMC6	P62333	389 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	AP1B1	Q10567	949 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	TMED2	Q15363	201 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	PID1	Q7Z2X4	250 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	UBA3	Q8TBC4	463 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	FAM71B	Q8TC56	605 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	RFFL	Q8WZ73	363 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	MRI	Q9BWK5	157 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	FAM86B1	E9PN63	330 aa		9.79	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	EXTL3	O43909	919 aa		9.79	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	PGK1	P00558	417 aa		9.79	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		9.79	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	FGFR4	P22455	802 aa		9.79	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
GGA3-223	ENST00000621870	HSD17B4	P51659	736 aa		9.79	□□□□□ -0.84

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