RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 MUTP22033 750 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 FSHRP23945 695 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 PPP2R5AQ15172 486 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 LIN9Q5TKA1 542 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 C8orf76Q96K31 380 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 SNX27Q96L92 541 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D17Q9HA65 648 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 NUMBLQ9Y6R0 609 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM12O43184 909 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 PDXDC1Q6P996 788 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 GDAQ9Y2T3 454 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 C8AP07357 584 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 RFX1P22670 979 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 HOXA9P31269 272 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 EFNA5P52803 228 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 ECM1Q16610 540 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 PPM1LQ5SGD2 360 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 HAUS3Q68CZ6 603 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 IFT74Q96LB3 600 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 POLD4Q9HCU8 107 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF3Q9NR81 526 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRF-216ENST00000617451 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
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PTPRF-216ENST00000617451 TTC38Q5R3I4 469 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 KIFAP3Q92845 792 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 CDH7Q9ULB5 785 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF292O60281 2723 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 FGFR3P22607 806 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 RAB33AQ14088 237 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 C4orf32Q8N8J7 132 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 FGF14Q92915 247 aa27.44■■□□□ 1.98
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PTPRF-216ENST00000617451 BHMT2Q9H2M3 363 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 DCHS1Q96JQ0 3298 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 VWA8A3KMH1 1905 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 CCL16O15467 120 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 OR1D2P34982 312 aa27.43■■□□□ 1.98
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PTPRF-216ENST00000617451 ATF7IP2Q5U623 682 aa27.43■■□□□ 1.98
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PTPRF-216ENST00000617451 PARM1Q6UWI2 310 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 ADSSL1Q8N142 457 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 FGF13Q92913 245 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 SIT1Q9Y3P8 196 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 XYLBO75191 536 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 B3GAT3O94766 335 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 SEC24BO95487 1268 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 POU2F2P09086 479 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 TRAPPC10P48553 1259 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 UVSSAQ2YD98 709 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 CD300LGQ6UXG3 332 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 SLC7A14Q8TBB6 771 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 MTRRQ9UBK8 725 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 LRWD1Q9UFC0 647 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 POLIQ9UNA4 740 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1024Q9UPX6 916 aa27.42■■□□□ 1.98
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PTPRF-216ENST00000617451 UROC1Q96N76 676 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 TNFSF13BQ9Y275 285 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 FRYLO94915 3013 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 K7ERI5 159 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 PDIA5Q14554 519 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 SPECC1Q5M775 1068 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 MTSS1LQ765P7 747 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 RTL10Q7L3V2 364 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 ITFG1Q8TB96 612 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 BACE2Q9Y5Z0 518 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 STARD6P59095 220 aa27.39■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
PTPRF-216ENST00000617451 NBR1Q14596 966 aa27.39■■□□□ 1.98
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