RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614775.4

SMIM20-205, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 1,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-205ENST00000614775 UVSSAQ2YD98 709 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 RDM1Q8NG50 284 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 SLC5A5Q92911 643 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 TTPALQ9BTX7 342 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 RHOP08100 348 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 CPA1P15085 419 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 CEBPBP17676 345 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 SPINK2P20155 84 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 FOXC1Q12948 553 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 ANO5Q75V66 913 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 RUFY3Q7L099 469 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 IRF7Q92985 503 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 GJA10Q969M2 543 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 APOL6Q9BWW8 343 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 EDIL3O43854 480 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 PTGDRQ13258 359 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 CEP57Q86XR8 500 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 GATA6Q92908 595 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 LOXL4Q96JB6 756 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 ESYT2A0FGR8 921 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 TSPAN1O60635 241 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 ERLIN2O94905 339 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 EPN2O95208 641 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 GRIK3Q13003 919 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 RAB33AQ14088 237 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 PLA2G2CQ5R387 149 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 APOA5Q6Q788 366 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 Q6ZUG5 572 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 RTL10Q7L3V2 364 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 HASPINQ8TF76 798 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 CCDC51Q96ER9 411 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 VWA8A3KMH1 1905 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 GIPC1O14908 333 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 PSMD10O75832 226 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 CCNE1P24864 410 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 AXLP30530 894 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 HOXA6P31267 233 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 HOXC13P31276 330 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 RAP1GAPP47736 663 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 RTN1Q16799 776 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 NOTUMQ6P988 496 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 TMEM143Q96AN5 459 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 CPB2Q96IY4 423 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 CSRNP2Q9H175 543 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM20-205ENST00000614775 SPAG17Q6Q759 2223 aa20.08■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 TAF4O00268 1085 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 KIF4AO95239 1232 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 AKAP5P24588 427 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 GDI1P31150 447 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 LRRC32Q14392 662 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 Q6ZS52 159 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 FBXL16Q8N461 479 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 RNF149Q8NC42 400 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 BRF1Q92994 677 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM20-205ENST00000614775 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms