RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BTDP43251 543 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PSMC4P43686 418 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MARCKSL1P49006 195 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MXRA7P84157 204 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPARDQ03181 441 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KRT72Q14CN4 511 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GRIK5Q16478 980 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCNG2Q16589 344 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KYNUQ16719 465 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UBE2SQ16763 222 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PTPROQ16827 1216 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CTC1Q2NKJ3 1217 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CBWD6Q4V339 395 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TCERG1LQ5VWI1 586 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AADACL2Q6P093 401 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 POTEGQ6S5H5 508 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LONP2Q86WA8 852 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VSIG1Q86XK7 387 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PALB2Q86YC2 1186 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLF2Q8IX21 1173 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF276Q8N554 614 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KIFAP3Q92845 792 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ITFG2Q969R8 447 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ERP27Q96DN0 273 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FAM81BQ96LP2 452 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TTC25Q96NG3 672 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ANO3Q9BYT9 981 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DCLK3Q9C098 648 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 YIPF3Q9GZM5 350 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RGL1Q9NZL6 768 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PDP2Q9P2J9 529 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DNAJB4Q9UDY4 337 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GGT7Q9UJ14 662 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VAV3Q9UKW4 847 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C2CD2Q9Y426 696 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MYH11P35749 1972 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 A8MXQ7 604 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RSPH10B2B2RC85 870 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 F5H6K3 240 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 F8W8V4 182 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PIK3CDO00329 1044 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLIC2O15247 247 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ALOX15BO15296 676 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GSC2O15499 205 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 THAP12O43422 761 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TYROBPO43914 113 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GRIN3BO60391 1043 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC22O60826 627 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SMIM24O75264 130 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TBCAO75347 108 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RNF8O76064 485 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TJP3O95049 919 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GCNT3O95395 438 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ACSL3O95573 720 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GAS8O95995 478 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RSPH10BP0C881 870 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATF2P15336 505 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TSHRP16473 764 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KLRC2P26717 231 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 STAT3P40763 770 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PEX19P40855 299 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SSR1P43307 286 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAGEA4P43358 317 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms