RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603487.1

SMC2-AS1-201, Transcript of SMC2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC2-AS1, Length 7,020 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MSH3P20585 1137 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SLCO1A2P46721 670 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SLC16A1P53985 500 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 COPS2P61201 443 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DGCR6Q14129 220 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HIC1Q14526 733 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 WLSQ5T9L3 541 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PCGF5Q86SE9 256 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 COG3Q96JB2 828 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MAGED4Q96JG8 741 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TTC25Q96NG3 672 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TRIM2Q9C040 744 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MROH8Q9H579 483 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TMEM138Q9NPI0 162 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SBNO1A3KN83 1393 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 UBE2QL1A1L167 161 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TEX46H3BTG2 121 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PSMD11O00231 422 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF213O14771 459 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF202O95125 648 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 WARSP23381 471 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RRM2P31350 389 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DEFA5Q01523 94 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MYL5Q02045 173 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LBRQ14739 615 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SNX30Q5VWJ9 437 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF786Q8N393 782 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DNAAF3Q8N9W5 541 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TCEANC2Q96MN5 208 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KLHL3Q9UH77 587 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NOD1Q9Y239 953 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MLH3Q9UHC1 1453 aa5.26□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SASH3O75995 380 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ANXA1P04083 346 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TAC1P20366 129 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MTHFSP49914 203 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 EHHADHQ08426 723 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NCF4Q15080 339 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CCDC184Q52MB2 194 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RFKQ969G6 155 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CNKSR1Q969H4 720 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ACAD9Q9H845 621 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MYOM2P54296 1465 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 M0R2C6 588 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 USP1O94782 785 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NOL4O94818 638 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZBED1O96006 694 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PGM1P36871 562 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ADRM1Q16186 407 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NDUFAF6Q330K2 333 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GPIHBP1Q8IV16 184 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LRRC17Q8N6Y2 441 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 L1RE1Q9UN81 338 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 NUDT7P0C024 238 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 STAT5AP42229 794 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 STAT5BP51692 787 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 EPHB4P54760 987 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ADAM17P78536 824 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IDI1Q13907 227 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DDR2Q16832 855 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SYT16Q17RD7 645 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ARHGEF16Q5VV41 709 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 BICRALQ6AI39 1079 aa5.25□□□□□ -1.57
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.9 ms