RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597777.1

FARP1-222, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, human

Gene FARP1, Length 3,841 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FARP1-222	ENST00000597777	KIF4A	O95239	1232 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	HOXC6	P09630	235 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ACTN2	P35609	894 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC63	Q8NA47	563 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	IFT74	Q96LB3	600 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	UCHL3	P15374	230 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	APLP1	P51693	650 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	STRN3	Q13033	797 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	TRPC3	Q13507	836 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	DENND2C	Q68D51	928 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	METTL7B	Q6UX53	244 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ARL8A	Q96BM9	186 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CPA4	Q9UI42	421 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	PLAA	Q9Y263	795 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	AKAP3	O75969	853 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ITGA4	P13612	1032 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	KRT15	P19012	456 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	IRX4	P78413	519 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ARSH	Q5FYA8	562 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ARMCX2	Q7L311	632 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	KAT5	Q92993	513 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CENPF	P49454	3210 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	SERPING1	P05155	500 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	GAP43	P17677	238 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	GUCY2C	P25092	1073 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CETN2	P41208	172 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ACTR2	P61160	394 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	SP2	Q02086	613 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	C7orf31	Q8N865	590 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	SCFD2	Q8WU76	684 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CLTA	P09496	248 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC172	P0C7W6	258 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	FGFR4	P22455	802 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	TTLL4	Q14679	1199 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	MDM1	Q8TC05	714 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	USP6NL	Q92738	828 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	MAML3	Q96JK9	1138 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	PPME1	Q9Y570	386 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	LRRC63	Q05C16	580 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	MAP2K5	Q13163	448 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CRHR2	Q13324	411 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	GIT2	Q14161	759 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	DPP9	Q86TI2	863 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	GJB6	O95452	261 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	FAM153B	P0C7A2	387 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	GALC	P54803	685 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	FAM153C	Q494X1	144 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	PDXDC1	Q6P996	788 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FARP1-222	ENST00000597777	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73

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