RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 IL31RAQ8NI17 732 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SYT11Q9BT88 431 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MTFR1LQ9H019 292 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF146Q9NTX7 359 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 NFU1Q9UMS0 254 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 NFASCO94856 1347 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC169A6NNP5 214 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 AGPSO00116 658 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 BACH1O14867 736 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB39O15060 712 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRN2O75325 713 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PPFIA4O75335 1185 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB7AO95365 584 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GLI1P08151 1106 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 POLD1P28340 1107 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ABL2P42684 1182 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE6CP51160 858 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CDR1P51861 262 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PEX3P56589 373 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT39Q6A163 491 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 NSMFQ6X4W1 530 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 KSR1Q8IVT5 923 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PBXIP1Q96AQ6 731 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM11Q96F44 468 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 IFT74Q96LB3 600 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 C12orf42Q96LP6 360 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 NT5C1BQ96P26 610 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PLVAPQ9BX97 442 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR88Q9GZN0 384 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MYH11P35749 1972 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MYPNQ86TC9 1320 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 C19orf81C9J6K1 198 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 VWA5AO00534 786 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC16A4O15374 487 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RTN2O75298 545 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MTA2O94776 668 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GZMAP12544 262 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCB4P21439 1286 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNA3P22001 575 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GCLMP48507 274 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 GPC5P78333 572 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TEPSINQ96N21 525 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ZIM3Q96PE6 472 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PCIF1Q9H4Z3 704 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 POLD4Q9HCU8 107 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PARP2Q9UGN5 583 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 TBX20Q9UMR3 447 aa9.9□□□□□ -0.82
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms