RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579316.5

CSNK1D-211, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-211ENST00000579316 MCRS1Q96EZ8 462 aa15.45■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.45■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 BRD9Q9H8M2 597 aa15.45■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 C6orf50Q9HD87 102 aa15.45■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.45■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PPME1Q9Y570 386 aa15.45■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 LAMA1P25391 3075 aa15.45■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ERLIN2O94905 339 aa15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 RHOP08100 348 aa15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PTGDRQ13258 359 aa15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PLA2G4FQ68DD2 849 aa15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 LRSAM1Q6UWE0 723 aa15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 EXOC8Q8IYI6 725 aa15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 HACE1Q8IYU2 909 aa15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 CSRNP2Q9H175 543 aa15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.44■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 VWA8A3KMH1 1905 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ZBTB43O43298 467 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 EPN2O95208 641 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 CEBPBP17676 345 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 GNA11P29992 359 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 USP11P51784 963 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PSMC5P62195 406 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 GRM2Q14416 872 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PLA2G2CQ5R387 149 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 CEP68Q76N32 757 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 RABGGTAQ92696 567 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 GJA10Q969M2 543 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa15.43■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ASAP2O43150 1006 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 MICAL2O94851 1124 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 KIF4AO95239 1232 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 RFC5P40937 340 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 RAP1GAPP47736 663 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 RCAN1P53805 252 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 NPEPPSP55786 919 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 TUSC3Q13454 348 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 LRRC32Q14392 662 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 Q4G0T1 1027 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PRSS36Q5K4E3 855 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 C1orf228Q6PIY5 440 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 FERMT3Q86UX7 667 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 RNF149Q8NC42 400 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 TMEM143Q96AN5 459 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 MSANTD3Q96H12 275 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 APOL6Q9BWW8 343 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ARNTLO00327 626 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 SLC27A2O14975 620 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PSMC3P17980 439 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 AKAP5P24588 427 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 CDC27P30260 824 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 OR1D2P34982 312 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PTENP60484 403 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 AMHR2Q16671 573 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 BICD2Q8TD16 824 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 GATA6Q92908 595 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 CPB2Q96IY4 423 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ASB16Q96NS5 453 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 MTRRQ9UBK8 725 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.41■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 LAMA5O15230 3695 aa15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 AXIN1O15169 862 aa15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 GDI1P31150 447 aa15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 RING1Q06587 406 aa15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 SPIRE1Q08AE8 756 aa15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 VITQ6UXI7 678 aa15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 CEP57Q86XR8 500 aa15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 HASPINQ8TF76 798 aa15.4■□□□□ 0.06
CSNK1D-211ENST00000579316 TCP11Q8WWU5 503 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms