RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 B4GALT5O43286 388 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 P4HBP07237 508 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 RHOP08100 348 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 YWHABP31946 246 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CXCL12P48061 93 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 FNTBP49356 437 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 SATB1Q01826 763 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 TUSC3Q13454 348 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 XKR9Q5GH70 373 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 POTEHQ6S545 545 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM3CQ92520 227 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 DNASE1L2Q92874 299 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 MTRQ99707 1265 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 DOCK6Q96HP0 2047 aa18.08■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CEP295Q9C0D2 2601 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 POU2F2P09086 479 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CPA1P15085 419 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CEBPBP17676 345 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 PMLP29590 882 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAB33AQ14088 237 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 TFDP1Q14186 410 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 AMHR2Q16671 573 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDXDC1Q6P996 788 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC27A1Q6PCB7 646 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 BRF1Q92994 677 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.07■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZZEF1O43149 2961 aa18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 WDR81Q562E7 1941 aa18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPP2R5CQ13362 524 aa18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 Q6ZUG5 572 aa18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 LXNQ9BS40 222 aa18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 IER2Q9BTL4 223 aa18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 RGL1Q9NZL6 768 aa18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 VAV3Q9UKW4 847 aa18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCDHA4Q9UN74 947 aa18.06■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC37A4O43826 429 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTPN2P17706 415 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CEP68Q76N32 757 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 C4orf19Q8IY42 314 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 IRF7Q92985 503 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 SH3GLB2Q9NR46 395 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 SPEGQ15772 3267 aa18.05■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 A0A1B0GUA9 196 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 FCARP24071 287 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 GDI1P31150 447 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 SHC2P98077 582 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CAPSQ13938 189 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 KRT32Q14532 448 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 NTRK3Q16288 839 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 DYDC2Q96IM9 177 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CORO1BQ9BR76 489 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa18.04■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 MARCH6O60337 910 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRG1P02750 347 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 THP07101 528 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CHRNB1P11230 501 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCNE1P24864 410 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CNR2P34972 360 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CYP4A11Q02928 519 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 POU5F1BQ06416 359 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 GAS6Q14393 721 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 EPHA7Q15375 998 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCDC6Q16204 474 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 INF2Q27J81 1249 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 MOXD1Q6UVY6 613 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 RTL10Q7L3V2 364 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 LONP2Q86WA8 852 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 BLIDQ8IZY5 108 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 TCEAL4Q96EI5 215 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM20AQ96MK3 541 aa18.03■□□□□ 0.48
CTDNEP1-211ENST00000575783 CXCL16Q9H2A7 254 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms