RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARNS1A5YM72 827 aa36.06■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RB1P06400 928 aa36.06■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SAAL1Q96ER3 474 aa36.06■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF558Q96NG5 402 aa36.05■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB123Q8N688 67 aa36.04■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 COLGALT2Q8IYK4 626 aa36.03■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CD302Q8IX05 232 aa36.03■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM174Q8WUU8 243 aa36.03■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa36.03■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPOPA6NHQ4 379 aa36.02■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 BIN1O00499 593 aa36.02■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPM1AP35813 382 aa36.02■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUSC3Q13454 348 aa36.02■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAB2Q15742 525 aa36.02■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa36.02■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-209ENST00000574205 XXYLT1Q8NBI6 393 aa36■■■■□ 3.35
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1G1P47890 313 aa35.98■■■■□ 3.35
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MTMR10Q9NXD2 777 aa35.98■■■■□ 3.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa35.97■■■■□ 3.35
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF18O76093 207 aa35.97■■■■□ 3.35
CTDNEP1-209ENST00000574205 NR3C1P04150 777 aa35.97■■■■□ 3.35
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