RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569341.1

CFDP1-208, Transcript of craniofacial development protein 1, human

TSL 3

Gene CFDP1, Length 454 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC26A4	O43511	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ADCY3	O60266	1144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PEX11B	O96011	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SYT1	P21579	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	HOXC9	P31274	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ECE1	P42892	770 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	HHEX	Q03014	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	KRT32	Q14532	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SYCP1	Q15431	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SEC23A	Q15436	765 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	G2E3	Q7L622	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341		Q9UFV3	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	DCC	P43146	1447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ARVCF	O00192	962 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	NEMF	O60524	1076 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ADCY5	O95622	1261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	TUBB4A	P04350	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	NAT1	P18440	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PROZ	P22891	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	STAT5B	P51692	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	AK2	P54819	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	HERVK_113	P62684	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	KRT85	P78386	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	MOGS	Q13724	837 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	UTY	O14607	1347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	GSTA4	O15217	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CTAGE5	O15320	804 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	CRTAM	O95727	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	MME	P08473	750 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	ADRA1B	P35368	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CFDP1-208	ENST00000569341	IL12RB1	P42701	662 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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