RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 C9IYK1 514 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 ENPP3O14638 875 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 CXCL8P10145 99 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 KRT13P13646 458 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 RAB27AP51159 221 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 VAMP7P51809 220 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 MAN2A1Q16706 1144 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 MIIPQ5JXC2 388 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 TMC2Q8TDI7 906 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 APOL6Q9BWW8 343 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 RNF39Q9H2S5 420 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PDE11AQ9HCR9 933 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 C1orf112Q9NSG2 853 aa16.76■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 SERPINC1P01008 464 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 SKIP12755 728 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 AKAP5P24588 427 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 DLG4P78352 724 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 FAM189BP81408 668 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 ENPEPQ07075 957 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.278e-9■■□□□ 13.7
CTU2-209ENST00000567316 SARM1Q6SZW1 724 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 SLC35C1Q96A29 364 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 VPS16Q9H269 839 aa16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 TTC26A0AVF1 554 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 MEIS3P2A8K0S8 358 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 LACTBL1A8MY62 500 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 RECQL4O94761 1208 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 IL18RAPO95256 599 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PFKMP08237 780 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 TRIM49P0CI25 452 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 TRIM49CP0CI26 452 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 ITGA4P13612 1032 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 EPHB4P54760 987 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PLCB2Q00722 1185 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 SURF1Q15526 300 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 VWA3BQ502W6 1294 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 LPPQ93052 612 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 FAM212AQ96EL1 285 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 CXCL16Q9H2A7 254 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 IL23AQ9NPF7 189 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PARP2Q9UGN5 583 aa16.74■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 A0A1B0GTH6 734 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 EOMESO95936 686 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 ACRP10323 421 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 MRE11P49959 708 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 YARSP54577 528 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 UBASH3AP57075 661 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 CLDN10P78369 228 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 KCNH2Q12809 1159 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 IKBKEQ14164 716 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 SHHQ15465 462 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 USP37Q86T82 979 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 HACE1Q8IYU2 909 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 ZNF516Q92618 1163 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PGBD4Q96DM1 585 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 SNX27Q96L92 541 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 FNBP1Q96RU3 617 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 CGRRF1Q99675 332 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 NDST4Q9H3R1 872 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 ASB7Q9H672 318 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 KLK14Q9P0G3 267 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 IFNKQ9P0W0 207 aa16.73■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PTPRJQ12913 1337 aa16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 TPM2P07951 284 aa16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 PPP3CAQ08209 521 aa16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 FILIP1LQ4L180 1135 aa16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 XKR4Q5GH76 650 aa16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 CD302Q8IX05 232 aa16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CTU2-209ENST00000567316 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms