RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRM6O15303 877 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 TGFB1I1O43294 461 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGF18O76093 207 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMC2O95347 1197 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 THP07101 528 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC11A1P49279 550 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 DSC1Q08554 894 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMARCE1Q969G3 411 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.84■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 KYAT1Q16773 422 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 XKR4Q5GH76 650 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA20Q8TB22 786 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAAL1Q96ER3 474 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 GSDMAQ96QA5 445 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPG21Q9NZD8 308 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.83■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANK1P16157 1881 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSPG5O95196 566 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALDH2P05091 517 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOSL2P15408 326 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 GARTP22102 1010 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR1G1P47890 313 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAB2Q15742 525 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAMK4Q16566 473 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 RABGGTAQ92696 567 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 RMND1Q9NWS8 449 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNTN3Q9P232 1028 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 NRP1O14786 923 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLIC2O15247 247 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJB1P25685 340 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPAG1Q07617 926 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM212AQ96EL1 285 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTC26A0AVF1 554 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 LACTBL1A8MY62 500 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNE1P15382 129 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPM1AP35813 382 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 TUSC3Q13454 348 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 ISM2Q6H9L7 571 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.81■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 REV3LO60673 3130 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 F8W810 466 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLCB3Q01970 1234 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 POF1BQ8WVV4 589 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGSF21Q96ID5 467 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYO7AQ13402 2215 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 EYSQ5T1H1 3165 aa22.8■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAMK1Q14012 370 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM169Q96HH4 297 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 EXTL3O43909 919 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP2J2P51589 502 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT17Q04695 432 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPD1LQ8N335 351 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 MARCH5Q9NX47 278 aa22.79■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADRB2P07550 413 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPROQ16827 1216 aa22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms