RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	SFI1	A8K8P3	1242 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	AVPR2	P30518	371 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	MCM2	P49736	904 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPN5	P54829	565 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNK18	Q7Z418	384 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	CLUH	O75153	1309 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC16A4	O15374	487 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	LIN9	Q5TKA1	542 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR65	Q8IYL9	337 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	B3GAT3	O94766	335 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	STRN3	Q13033	797 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	DAW1	Q8N136	415 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	CEP120	Q8N960	986 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	CDT1	Q9H211	546 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNK12	Q9HB15	430 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	MRE11	P49959	708 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	CLCNKB	P51801	687 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	SMTN	P53814	917 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	TDG	Q13569	410 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	NAB2	Q15742	525 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	PDXDC1	Q6P996	788 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	GRM5	P41594	1212 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	LILRA6	Q6PI73	481 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	UROC1	Q96N76	676 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	PNMA5	Q96PV4	448 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	POLI	Q9UNA4	740 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ZMYND10	O75800	440 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	C1R	P00736	705 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	MAPK7	Q13164	816 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	FLCN	Q8NFG4	579 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ACAP3	Q96P50	834 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	TRAPPC3	O43617	180 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	PLA2G4B	P0C869	781 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	GUCY2C	P25092	1073 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-208	ENST00000564966		I3L4J1	428 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	C8A	P07357	584 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	MCF2	P10911	925 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	PLS3	P13797	630 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	CALML4	Q96GE6	196 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	MYADM	Q96S97	322 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	RFX1	P22670	979 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	OR1D2	P34982	312 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	UBA7	P41226	1012 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	TCF15	Q12870	199 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	UPP1	Q16831	310 aa		27.75	■■■□□ 2.03

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