RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACOT2P49753 483 aa22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BIRC3Q13489 604 aa22.93■■□□□ 1.26
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.93■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.93■■□□□ 1.26
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OPA1O60313 960 aa22.91■■□□□ 1.26
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSF2BPO75031 334 aa22.91■■□□□ 1.26
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ESYT3A0FGR9 886 aa22.89■■□□□ 1.25
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.89■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYT17Q9BSW7 474 aa22.89■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.89■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRPC6Q9Y210 931 aa22.89■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AGPSO00116 658 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRIN3BO60391 1043 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COMTP21964 271 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERVK-9P63128 1117 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CUL2Q13617 745 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTLL4Q14679 1199 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLCB4Q15147 1175 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SURF1Q15526 300 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAPK6Q16659 721 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR78Q5VTH9 848 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.88■■□□□ 1.25
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.88■■□□□ 1.25
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