RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.41■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.41■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNA2P16389 499 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 RWDD2BP57060 319 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC25Q86WR0 208 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPD1LQ8N335 351 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 HERPUD2Q9BSE4 406 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 26.8
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMC2Q8TDI7 906 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIFAP3Q92845 792 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.4■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 PODXLO00592 558 aa21.39■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCND2P30279 289 aa21.39■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP1B1Q16678 543 aa21.39■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.39■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.39■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.39■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.39■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.39■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
AFG3L1P-217ENST00000557444 GGPS1O95749 300 aa21.39■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 CFHP08603 1231 aa21.39■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 RRM1P23921 792 aa21.39■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOOK3Q86VS8 718 aa21.39■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 MORC4Q8TE76 937 aa21.39■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 O00370 1275 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 RXRBP28702 533 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAPK4P31152 587 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRKCEQ02156 737 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHST7Q9NS84 486 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPRJQ12913 1337 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 ACOT2P49753 483 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPRED3Q2MJR0 410 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTERF2Q49AM1 385 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 HVCN1Q96D96 273 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.38■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 TP73O15350 636 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAEPP09466 180 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHN1P15882 459 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCP2P22307 547 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP1R7Q15435 360 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 MICALCLQ6ZW33 695 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 ART4Q93070 314 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIPK2O43353 540 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 FNTAP49354 379 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 HMGCS2P54868 508 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 SGO2Q562F6 1265 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 PASD1Q8IV76 773 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPRASP2Q96D09 838 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.37■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARID2Q68CP9 1835 aa21.37■■□□□ 1.01
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AFG3L1P-217ENST00000557444 ECEL1O95672 775 aa21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 BACE1P56817 501 aa21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC38Q502W7 563 aa21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 REPS2Q8NFH8 660 aa21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM143Q96AN5 459 aa21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 HACL1Q9UJ83 578 aa21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYPNQ86TC9 1320 aa21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 PASKQ96RG2 1323 aa21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
AFG3L1P-217ENST00000557444 DGAT1O75907 488 aa21.36■■□□□ 1.01
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