RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	NSMF	Q6X4W1	530 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	LBX2	Q6XYB7	198 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	HOMER1	Q86YM7	354 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	OXR1	Q8N573	874 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	DEFB118	Q96PH6	123 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MYL10	Q9BUA6	226 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	EBF1	Q9UH73	591 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	GJD2	Q9UKL4	321 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RIPK3	Q9Y572	518 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0G2JMZ2	1700 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	LCT	P09848	1927 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNH1	O95259	989 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	PDHB	P11177	359 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CALML3	P27482	149 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMA5	P28066	241 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP2C19	P33261	490 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CHRNE	Q04844	493 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT32	Q14532	448 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC14A2	Q15849	920 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	FYB2	Q5VWT5	728 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288		Q6ZUG5	572 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	TMTC2	Q8N394	836 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	BVES	Q8NE79	360 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MYLIP	Q8WY64	445 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	DPF3	Q92784	378 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	DRC1	Q96MC2	740 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF146	Q9NTX7	359 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	EVPL	Q92817	2033 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	FITM1	A5D6W6	292 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	HPX	P02790	462 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	HMGCR	P04035	888 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	IFNGR1	P15260	489 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGB5	P18084	799 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	KIF5B	P33176	963 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	COPB2	P35606	906 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ANTXR2	P58335	489 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	AMPD2	Q01433	879 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CNTN2	Q02246	1040 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SEC23A	Q15436	765 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RTP2	Q5QGT7	225 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	NAT16	Q8N8M0	369 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CHST13	Q8NET6	341 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIB2	Q92519	343 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	KIRREL1	Q96J84	757 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MAP6	Q96JE9	813 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	LGR4	Q9BXB1	951 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ACAD9	Q9H845	621 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO40	Q9UH90	709 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ALPK3	Q96L96	1907 aa		5.36	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RPTOR	Q8N122	1335 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	STXBP3	O00186	592 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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