RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554070.1

AREL1-208, Transcript of apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 3

Gene AREL1, Length 742 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AREL1-208	ENST00000554070	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	KCNK12	Q9HB15	430 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	KIF3A	Q9Y496	699 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	CLUH	O75153	1309 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PAPLN	O95428	1278 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	MAPK7	Q13164	816 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	TDG	Q13569	410 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	CEP120	Q8N960	986 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	STAM	Q92783	540 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	MYADM	Q96S97	322 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PIDD1	Q9HB75	910 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	SFI1	A8K8P3	1242 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ADAM12	O43184	909 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ZMYND10	O75800	440 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	GJB2	P29033	226 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	GRM5	P41594	1212 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	CLCNKB	P51801	687 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PSMD5	Q16401	504 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	DRC1	Q96MC2	740 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PNMA5	Q96PV4	448 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PLIN2	Q99541	437 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	CDT1	Q9H211	546 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070		H3BQV1	296 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	SLC16A4	O15374	487 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	B3GAT3	O94766	335 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	FGFR3	P22607	806 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	OSTN	P61366	133 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	HYI	Q5T013	277 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	TRIO	O75962	3097 aa		12.77	□□□□□ -0.36
AREL1-208	ENST00000554070	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070		H0Y858	1186 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070		I3L4J1	428 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	ABLIM1	O14639	778 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	PROZ	P22891	400 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	GUCY2C	P25092	1073 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	NUBP1	P53384	320 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	UPP1	Q16831	310 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	XKR4	Q5GH76	650 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	PDXDC1	Q6P996	788 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	FLCN	Q8NFG4	579 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	UROC1	Q96N76	676 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	TCHP	Q9BT92	498 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AREL1-208	ENST00000554070	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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